陕西中医药大学第二附属医院（西咸新区中心医院）病理科成立于1979年。现有西咸院区及秦都院区。西咸院区位于1号楼3层，占地面积1000多平方米；秦都院区位于渭阳西路5号，目前科室承担全院及外院的各类临床病理诊断工作，现每年仅活检量达到上万例。